Aufgrund der öffentlichen Bekanntgabe der Modellschulen ist ein sorgsamer Umgang mit den im Rahmen der Evaluation anfallenden Daten besonders wichtig. Alle erhaltenen Daten werden gemäss dem Bundesgesetz über den Datenschutz (DSG) SR-Nr. 235.1 vom 19. Juni 1992 bearbeitet. Zudem werden die Forschungsdatenmanagement- und Datenschutz-Richtlinien der Pädagogischen Hochschule Sankt Gallen strikt eingehalten. Für die Auswertungen werden alle Daten anonymisiert. Folglich sind keine Rückschlüsse auf einzelne Schulleitungen, Lehrpersonen, Schulkinder oder Klassen möglich.